Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
AFDNP55196 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
AFDNP55196 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
AFDNP55196 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
AFDNP55196 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
AFDNP55196 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
AFDNP55196 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
AFDNP55196 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
AFDNP55196 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
AFDNP55196 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
AFDNP55196 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AFDNP55196 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
AFDNP55196 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
AFDNP55196 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
AFDNP55196 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
AFDNP55196 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
AFDNP55196 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
AFDNP55196 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AFDNP55196 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AFDNP55196 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AFDNP55196 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AFDNP55196 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AFDNP55196 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AFDNP55196 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
AFDNP55196 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AFDNP55196 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AFDNP55196 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AFDNP55196 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AFDNP55196 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AFDNP55196 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AFDNP55196 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AFDNP55196 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AFDNP55196 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AFDNP55196 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AFDNP55196 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AFDNP55196 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AFDNP55196 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AFDNP55196 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AFDNP55196 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AFDNP55196 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AFDNP55196 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AFDNP55196 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AFDNP55196 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AFDNP55196 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AFDNP55196 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AFDNP55196 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AFDNP55196 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
AFDNP55196 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AFDNP55196 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AFDNP55196 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AFDNP55196 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AFDNP55196 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
AFDNP55196 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AFDNP55196 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AFDNP55196 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AFDNP55196 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AFDNP55196 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AFDNP55196 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
AFDNP55196 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AFDNP55196 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AFDNP55196 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AFDNP55196 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AFDNP55196 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AFDNP55196 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AFDNP55196 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AFDNP55196 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AFDNP55196 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AFDNP55196 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AFDNP55196 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AFDNP55196 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AFDNP55196 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
AFDNP55196 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AFDNP55196 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AFDNP55196 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AFDNP55196 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
AFDNP55196 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AFDNP55196 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
AFDNP55196 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AFDNP55196 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AFDNP55196 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AFDNP55196 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AFDNP55196 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AFDNP55196 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AFDNP55196 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AFDNP55196 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AFDNP55196 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AFDNP55196 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AFDNP55196 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AFDNP55196 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AFDNP55196 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AFDNP55196 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AFDNP55196 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AFDNP55196 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AFDNP55196 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AFDNP55196 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AFDNP55196 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AFDNP55196 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AFDNP55196 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AFDNP55196 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AFDNP55196 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms