Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBP50607 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBP50607 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBP50607 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBP50607 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBP50607 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBP50607 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBP50607 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBP50607 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBP50607 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBP50607 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBP50607 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBP50607 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBP50607 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBP50607 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBP50607 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBP50607 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBP50607 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBP50607 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBP50607 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBP50607 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBP50607 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBP50607 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBP50607 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBP50607 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBP50607 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBP50607 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBP50607 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBP50607 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBP50607 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBP50607 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBP50607 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBP50607 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBP50607 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBP50607 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBP50607 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBP50607 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBP50607 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBP50607 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBP50607 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBP50607 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBP50607 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBP50607 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBP50607 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBP50607 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBP50607 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBP50607 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBP50607 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBP50607 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBP50607 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBP50607 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBP50607 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBP50607 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBP50607 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBP50607 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBP50607 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBP50607 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBP50607 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBP50607 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBP50607 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBP50607 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBP50607 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBP50607 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBP50607 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBP50607 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBP50607 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBP50607 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBP50607 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBP50607 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBP50607 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBP50607 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBP50607 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBP50607 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBP50607 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBP50607 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBP50607 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBP50607 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBP50607 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBP50607 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBP50607 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBP50607 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBP50607 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBP50607 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBP50607 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBP50607 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBP50607 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBP50607 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBP50607 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBP50607 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBP50607 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBP50607 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBP50607 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBP50607 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBP50607 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBP50607 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBP50607 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBP50607 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBP50607 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBP50607 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBP50607 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms