Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEDD4P46934 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NEDD4P46934 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms