Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCAMP43121 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCAMP43121 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCAMP43121 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCAMP43121 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MCAMP43121 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MCAMP43121 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MCAMP43121 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MCAMP43121 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MCAMP43121 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MCAMP43121 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCAMP43121 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCAMP43121 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCAMP43121 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCAMP43121 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MCAMP43121 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCAMP43121 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCAMP43121 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCAMP43121 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCAMP43121 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCAMP43121 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MCAMP43121 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCAMP43121 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCAMP43121 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCAMP43121 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCAMP43121 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCAMP43121 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCAMP43121 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCAMP43121 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCAMP43121 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCAMP43121 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCAMP43121 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCAMP43121 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCAMP43121 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCAMP43121 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCAMP43121 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCAMP43121 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MCAMP43121 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MCAMP43121 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCAMP43121 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCAMP43121 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCAMP43121 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCAMP43121 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCAMP43121 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCAMP43121 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCAMP43121 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCAMP43121 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCAMP43121 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MCAMP43121 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCAMP43121 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCAMP43121 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCAMP43121 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCAMP43121 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MCAMP43121 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MCAMP43121 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCAMP43121 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MCAMP43121 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCAMP43121 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCAMP43121 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCAMP43121 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCAMP43121 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MCAMP43121 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCAMP43121 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCAMP43121 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MCAMP43121 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCAMP43121 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCAMP43121 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCAMP43121 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MCAMP43121 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCAMP43121 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MCAMP43121 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCAMP43121 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCAMP43121 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCAMP43121 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCAMP43121 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCAMP43121 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCAMP43121 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCAMP43121 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCAMP43121 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCAMP43121 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCAMP43121 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MCAMP43121 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCAMP43121 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MCAMP43121 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCAMP43121 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCAMP43121 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCAMP43121 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MCAMP43121 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCAMP43121 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCAMP43121 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCAMP43121 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCAMP43121 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCAMP43121 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCAMP43121 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCAMP43121 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MCAMP43121 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCAMP43121 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCAMP43121 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCAMP43121 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCAMP43121 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms