Protein–RNA interactions for Protein: P37020

GEF1, Anion/proton exchange transporter GEF1, yeastyeast

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GEF1P37020 AAD4YDL243C 990 nt5.52□□□□□ -1.53
GEF1P37020 YGR042WYGR042W 816 nt5.52□□□□□ -1.53
GEF1P37020 SLX9YGR081C 633 nt5.52□□□□□ -1.53
GEF1P37020 OAR1YKL055C 837 nt5.52□□□□□ -1.53
GEF1P37020 SRP21YKL122C 504 nt5.52□□□□□ -1.53
GEF1P37020 OM14YBR230C 405 nt5.52□□□□□ -1.53
GEF1P37020 UBP12YJL197W 3765 nt5.52□□□□□ -1.53
GEF1P37020 SPR3YGR059W 1539 nt5.52□□□□□ -1.53
GEF1P37020 SSY5YJL156C 2100 nt5.51□□□□□ -1.53
GEF1P37020 ISW2YOR304W 3363 nt5.51□□□□□ -1.53
GEF1P37020 HUL5YGL141W 2733 nt5.51□□□□□ -1.53
GEF1P37020 YDL199CYDL199C 2064 nt5.51□□□□□ -1.53
GEF1P37020 YDL016CYDL016C 303 nt5.51□□□□□ -1.53
GEF1P37020 RSM25YIL093C 795 nt5.51□□□□□ -1.53
GEF1P37020 RPL15BYMR121C 615 nt5.51□□□□□ -1.53
GEF1P37020 YNL324WYNL324W 396 nt5.51□□□□□ -1.53
GEF1P37020 YOR082CYOR082C 342 nt5.51□□□□□ -1.53
GEF1P37020 DUN1YDL101C 1542 nt5.51□□□□□ -1.53
GEF1P37020 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.51□□□□□ -1.53
GEF1P37020 RSC3YDR303C 2658 nt5.51□□□□□ -1.53
GEF1P37020 BLM10YFL007W 6432 nt5.5□□□□□ -1.53
GEF1P37020 ALO1YML086C 1581 nt5.5□□□□□ -1.53
GEF1P37020 YML096WYML096W 1578 nt5.5□□□□□ -1.53
GEF1P37020 CHK1YBR274W 1584 nt5.5□□□□□ -1.53
GEF1P37020 RTC1YOL138C 4026 nt5.5□□□□□ -1.53
GEF1P37020 YDR417CYDR417C 372 nt5.5□□□□□ -1.53
GEF1P37020 DSE2YHR143W 978 nt5.5□□□□□ -1.53
GEF1P37020 PRM6YML047C 1059 nt5.5□□□□□ -1.53
GEF1P37020 SPG4YMR107W 348 nt5.5□□□□□ -1.53
GEF1P37020 YPR170CYPR170C 336 nt5.5□□□□□ -1.53
GEF1P37020 SED4YCR067C 3198 nt5.5□□□□□ -1.53
GEF1P37020 DBP3YGL078C 1572 nt5.5□□□□□ -1.53
GEF1P37020 ANR2YKL047W 1551 nt5.5□□□□□ -1.53
GEF1P37020 UBP6YFR010W 1500 nt5.49□□□□□ -1.53
GEF1P37020 ALG6YOR002W 1635 nt5.49□□□□□ -1.53
GEF1P37020 YDR271CYDR271C 372 nt5.49□□□□□ -1.53
GEF1P37020 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt5.49□□□□□ -1.53
GEF1P37020 RPF1YHR088W 888 nt5.49□□□□□ -1.53
GEF1P37020 EAF6YJR082C 342 nt5.49□□□□□ -1.53
GEF1P37020 PIR1YKL164C 1026 nt5.49□□□□□ -1.53
GEF1P37020 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt5.49□□□□□ -1.53
GEF1P37020 YNL276CYNL276C 396 nt5.49□□□□□ -1.53
GEF1P37020 RPS19AYOL121C 435 nt5.49□□□□□ -1.53
GEF1P37020 QCR2YPR191W 1107 nt5.49□□□□□ -1.53
GEF1P37020 SUS1YBR111W-A 291 nt5.49□□□□□ -1.53
GEF1P37020 SLT2YHR030C 1455 nt5.49□□□□□ -1.53
GEF1P37020 PDR10YOR328W 4695 nt5.48□□□□□ -1.53
GEF1P37020 SAF1YBR280C 1914 nt5.48□□□□□ -1.53
GEF1P37020 YHR182WYHR182W 2358 nt5.48□□□□□ -1.53
GEF1P37020 TPO5YKL174C 1857 nt5.48□□□□□ -1.53
GEF1P37020 STE24YJR117W 1362 nt5.48□□□□□ -1.53
GEF1P37020 YDR199WYDR199W 366 nt5.48□□□□□ -1.53
GEF1P37020 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt5.48□□□□□ -1.53
GEF1P37020 GOS1YHL031C 672 nt5.48□□□□□ -1.53
GEF1P37020 SNX4YJL036W 1272 nt5.48□□□□□ -1.53
GEF1P37020 YJL114WYJL114W 681 nt5.48□□□□□ -1.53
GEF1P37020 YNL109WYNL109W 546 nt5.48□□□□□ -1.53
GEF1P37020 IST1YNL265C 897 nt5.48□□□□□ -1.53
GEF1P37020 YOR203WYOR203W 354 nt5.48□□□□□ -1.53
GEF1P37020 FUS2YMR232W 2034 nt5.47□□□□□ -1.53
GEF1P37020 YDL163WYDL163W 303 nt5.47□□□□□ -1.53
GEF1P37020 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt5.47□□□□□ -1.53
GEF1P37020 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt5.47□□□□□ -1.53
GEF1P37020 YKL023WYKL023W 834 nt5.47□□□□□ -1.53
GEF1P37020 YMR196WYMR196W 3267 nt5.47□□□□□ -1.53
GEF1P37020 SIN4YNL236W 2925 nt5.47□□□□□ -1.53
GEF1P37020 DAP2YHR028C 2457 nt5.47□□□□□ -1.53
GEF1P37020 CNN1YFR046C 1086 nt5.46□□□□□ -1.54
GEF1P37020 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt5.46□□□□□ -1.54
GEF1P37020 YML057C-AYML057C-A 390 nt5.46□□□□□ -1.54
GEF1P37020 PEP4YPL154C 1218 nt5.46□□□□□ -1.54
GEF1P37020 DSS4YPR017C 432 nt5.46□□□□□ -1.54
GEF1P37020 PHO88YBR106W 567 nt5.46□□□□□ -1.54
GEF1P37020 APD1YBR151W 951 nt5.46□□□□□ -1.54
GEF1P37020 OAF3YKR064W 2592 nt5.46□□□□□ -1.54
GEF1P37020 PDR5YOR153W 4536 nt5.46□□□□□ -1.54
GEF1P37020 DAL81YIR023W 2913 nt5.45□□□□□ -1.54
GEF1P37020 LAS1YKR063C 1509 nt5.45□□□□□ -1.54
GEF1P37020 RPA14YDR156W 414 nt5.45□□□□□ -1.54
GEF1P37020 MFA1YDR461W 111 nt5.45□□□□□ -1.54
GEF1P37020 AIM22YJL046W 1230 nt5.45□□□□□ -1.54
GEF1P37020 YET1YKL065C 621 nt5.45□□□□□ -1.54
GEF1P37020 BUR2YLR226W 1188 nt5.45□□□□□ -1.54
GEF1P37020 SAS2YMR127C 1017 nt5.45□□□□□ -1.54
GEF1P37020 YNL235CYNL235C 432 nt5.45□□□□□ -1.54
GEF1P37020 YPR136CYPR136C 513 nt5.45□□□□□ -1.54
GEF1P37020 YGR117CYGR117C 1431 nt5.45□□□□□ -1.54
GEF1P37020 PCI8YIL071C 1335 nt5.45□□□□□ -1.54
GEF1P37020 RSC6YCR052W 1452 nt5.45□□□□□ -1.54
GEF1P37020 YFR035CYFR035C 345 nt5.44□□□□□ -1.54
GEF1P37020 YGR045CYGR045C 363 nt5.44□□□□□ -1.54
GEF1P37020 YIL029CYIL029C 429 nt5.44□□□□□ -1.54
GEF1P37020 NMA1YLR328W 1206 nt5.44□□□□□ -1.54
GEF1P37020 YCL012CYCL012C 405 nt5.44□□□□□ -1.54
GEF1P37020 RAD54YGL163C 2697 nt5.44□□□□□ -1.54
GEF1P37020 AEP1YMR064W 1557 nt5.43□□□□□ -1.54
GEF1P37020 snR68snR68 136 nt5.43□□□□□ -1.54
GEF1P37020 FIN1YDR130C 876 nt5.43□□□□□ -1.54
GEF1P37020 TAM41YGR046W 1158 nt5.43□□□□□ -1.54
GEF1P37020 CIC1YHR052W 1131 nt5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.4 ms