Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL4P36578 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL4P36578 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL4P36578 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL4P36578 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL4P36578 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL4P36578 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL4P36578 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL4P36578 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL4P36578 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL4P36578 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL4P36578 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL4P36578 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL4P36578 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL4P36578 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL4P36578 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL4P36578 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL4P36578 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL4P36578 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL4P36578 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL4P36578 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPL4P36578 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPL4P36578 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPL4P36578 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPL4P36578 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPL4P36578 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPL4P36578 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPL4P36578 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL4P36578 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL4P36578 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL4P36578 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL4P36578 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL4P36578 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL4P36578 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL4P36578 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL4P36578 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL4P36578 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL4P36578 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL4P36578 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL4P36578 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL4P36578 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL4P36578 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL4P36578 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL4P36578 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL4P36578 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL4P36578 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL4P36578 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL4P36578 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL4P36578 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL4P36578 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL4P36578 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL4P36578 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL4P36578 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL4P36578 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL4P36578 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL4P36578 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL4P36578 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL4P36578 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL4P36578 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL4P36578 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL4P36578 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL4P36578 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL4P36578 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL4P36578 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL4P36578 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL4P36578 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL4P36578 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL4P36578 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL4P36578 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL4P36578 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL4P36578 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL4P36578 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL4P36578 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL4P36578 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL4P36578 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL4P36578 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL4P36578 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL4P36578 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL4P36578 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL4P36578 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL4P36578 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL4P36578 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL4P36578 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL4P36578 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL4P36578 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL4P36578 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL4P36578 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL4P36578 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL4P36578 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL4P36578 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL4P36578 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL4P36578 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL4P36578 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL4P36578 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL4P36578 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL4P36578 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL4P36578 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL4P36578 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL4P36578 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL4P36578 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms