Protein–RNA interactions for Protein: P32242

OTX1, Homeobox protein OTX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX1P32242 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTX1P32242 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTX1P32242 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTX1P32242 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTX1P32242 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTX1P32242 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTX1P32242 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
OTX1P32242 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTX1P32242 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTX1P32242 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTX1P32242 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTX1P32242 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTX1P32242 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTX1P32242 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTX1P32242 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
OTX1P32242 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTX1P32242 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTX1P32242 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTX1P32242 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTX1P32242 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTX1P32242 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTX1P32242 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTX1P32242 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTX1P32242 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
OTX1P32242 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTX1P32242 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
OTX1P32242 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTX1P32242 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTX1P32242 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTX1P32242 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTX1P32242 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTX1P32242 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTX1P32242 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTX1P32242 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTX1P32242 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTX1P32242 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
OTX1P32242 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTX1P32242 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTX1P32242 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
OTX1P32242 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTX1P32242 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTX1P32242 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTX1P32242 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTX1P32242 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTX1P32242 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTX1P32242 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
OTX1P32242 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
OTX1P32242 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
OTX1P32242 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
OTX1P32242 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTX1P32242 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTX1P32242 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTX1P32242 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTX1P32242 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTX1P32242 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTX1P32242 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTX1P32242 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTX1P32242 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTX1P32242 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTX1P32242 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
OTX1P32242 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTX1P32242 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTX1P32242 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTX1P32242 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OTX1P32242 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTX1P32242 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTX1P32242 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTX1P32242 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTX1P32242 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTX1P32242 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTX1P32242 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTX1P32242 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTX1P32242 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTX1P32242 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTX1P32242 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTX1P32242 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OTX1P32242 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX1P32242 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX1P32242 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX1P32242 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX1P32242 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX1P32242 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX1P32242 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX1P32242 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX1P32242 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX1P32242 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX1P32242 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX1P32242 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX1P32242 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX1P32242 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX1P32242 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX1P32242 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX1P32242 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX1P32242 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX1P32242 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX1P32242 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX1P32242 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX1P32242 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX1P32242 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OTX1P32242 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms