Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCKSP29966 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCKSP29966 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCKSP29966 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCKSP29966 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCKSP29966 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCKSP29966 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCKSP29966 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCKSP29966 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCKSP29966 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCKSP29966 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCKSP29966 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCKSP29966 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCKSP29966 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCKSP29966 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARCKSP29966 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARCKSP29966 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARCKSP29966 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARCKSP29966 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARCKSP29966 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARCKSP29966 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARCKSP29966 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARCKSP29966 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARCKSP29966 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MARCKSP29966 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MARCKSP29966 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MARCKSP29966 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARCKSP29966 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms