Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP1P29466 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP1P29466 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP1P29466 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP1P29466 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP1P29466 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP1P29466 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP1P29466 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP1P29466 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP1P29466 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP1P29466 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP1P29466 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP1P29466 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP1P29466 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP1P29466 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP1P29466 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP1P29466 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP1P29466 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP1P29466 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP1P29466 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP1P29466 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP1P29466 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP1P29466 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP1P29466 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP1P29466 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP1P29466 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP1P29466 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP1P29466 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP1P29466 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP1P29466 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP1P29466 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP1P29466 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP1P29466 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP1P29466 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP1P29466 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP1P29466 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP1P29466 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP1P29466 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP1P29466 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP1P29466 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP1P29466 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP1P29466 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP1P29466 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP1P29466 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP1P29466 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP1P29466 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP1P29466 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP1P29466 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP1P29466 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP1P29466 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP1P29466 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP1P29466 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP1P29466 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP1P29466 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP1P29466 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP1P29466 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP1P29466 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP1P29466 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP1P29466 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP1P29466 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP1P29466 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP1P29466 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP1P29466 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP1P29466 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP1P29466 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP1P29466 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP1P29466 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP1P29466 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP1P29466 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP1P29466 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP1P29466 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP1P29466 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP1P29466 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP1P29466 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP1P29466 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP1P29466 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP1P29466 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP1P29466 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP1P29466 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP1P29466 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP1P29466 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CASP1P29466 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CASP1P29466 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASP1P29466 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASP1P29466 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CASP1P29466 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CASP1P29466 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASP1P29466 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASP1P29466 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASP1P29466 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASP1P29466 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CASP1P29466 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASP1P29466 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASP1P29466 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASP1P29466 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASP1P29466 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASP1P29466 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASP1P29466 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASP1P29466 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASP1P29466 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms