Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CHMLP26374 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CHMLP26374 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CHMLP26374 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMLP26374 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMLP26374 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMLP26374 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMLP26374 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMLP26374 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMLP26374 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMLP26374 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMLP26374 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMLP26374 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMLP26374 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMLP26374 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMLP26374 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMLP26374 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMLP26374 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMLP26374 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMLP26374 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMLP26374 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMLP26374 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMLP26374 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMLP26374 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMLP26374 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMLP26374 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMLP26374 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMLP26374 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMLP26374 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMLP26374 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMLP26374 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMLP26374 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMLP26374 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMLP26374 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMLP26374 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMLP26374 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMLP26374 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMLP26374 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMLP26374 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMLP26374 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMLP26374 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMLP26374 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMLP26374 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMLP26374 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMLP26374 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMLP26374 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMLP26374 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMLP26374 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMLP26374 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMLP26374 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMLP26374 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMLP26374 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMLP26374 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMLP26374 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMLP26374 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMLP26374 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMLP26374 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMLP26374 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMLP26374 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMLP26374 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMLP26374 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMLP26374 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMLP26374 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMLP26374 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMLP26374 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMLP26374 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMLP26374 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMLP26374 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMLP26374 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMLP26374 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMLP26374 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMLP26374 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMLP26374 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMLP26374 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMLP26374 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMLP26374 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMLP26374 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMLP26374 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMLP26374 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMLP26374 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMLP26374 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMLP26374 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMLP26374 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMLP26374 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMLP26374 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMLP26374 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMLP26374 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMLP26374 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMLP26374 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMLP26374 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMLP26374 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMLP26374 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMLP26374 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMLP26374 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMLP26374 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMLP26374 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMLP26374 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMLP26374 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMLP26374 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMLP26374 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms