Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCHP24723 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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