Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ME2P23368 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ME2P23368 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ME2P23368 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ME2P23368 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ME2P23368 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ME2P23368 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ME2P23368 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ME2P23368 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ME2P23368 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ME2P23368 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ME2P23368 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ME2P23368 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ME2P23368 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ME2P23368 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ME2P23368 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ME2P23368 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ME2P23368 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ME2P23368 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ME2P23368 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ME2P23368 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ME2P23368 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ME2P23368 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ME2P23368 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ME2P23368 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ME2P23368 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ME2P23368 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ME2P23368 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ME2P23368 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ME2P23368 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ME2P23368 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ME2P23368 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ME2P23368 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ME2P23368 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ME2P23368 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ME2P23368 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ME2P23368 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ME2P23368 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ME2P23368 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ME2P23368 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ME2P23368 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ME2P23368 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ME2P23368 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ME2P23368 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ME2P23368 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ME2P23368 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ME2P23368 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ME2P23368 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ME2P23368 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ME2P23368 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ME2P23368 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ME2P23368 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ME2P23368 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ME2P23368 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ME2P23368 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ME2P23368 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ME2P23368 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ME2P23368 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ME2P23368 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ME2P23368 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ME2P23368 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ME2P23368 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ME2P23368 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ME2P23368 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ME2P23368 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ME2P23368 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ME2P23368 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ME2P23368 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ME2P23368 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ME2P23368 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ME2P23368 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ME2P23368 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ME2P23368 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ME2P23368 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ME2P23368 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ME2P23368 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ME2P23368 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ME2P23368 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ME2P23368 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ME2P23368 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ME2P23368 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ME2P23368 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ME2P23368 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ME2P23368 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ME2P23368 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ME2P23368 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ME2P23368 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ME2P23368 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ME2P23368 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ME2P23368 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ME2P23368 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ME2P23368 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ME2P23368 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ME2P23368 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ME2P23368 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ME2P23368 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ME2P23368 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ME2P23368 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ME2P23368 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ME2P23368 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms