Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACO1P21399 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACO1P21399 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACO1P21399 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACO1P21399 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACO1P21399 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACO1P21399 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACO1P21399 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACO1P21399 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACO1P21399 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ACO1P21399 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ACO1P21399 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACO1P21399 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACO1P21399 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACO1P21399 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ACO1P21399 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACO1P21399 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACO1P21399 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACO1P21399 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ACO1P21399 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACO1P21399 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ACO1P21399 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACO1P21399 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACO1P21399 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACO1P21399 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ACO1P21399 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACO1P21399 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACO1P21399 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACO1P21399 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ACO1P21399 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACO1P21399 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACO1P21399 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACO1P21399 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ACO1P21399 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACO1P21399 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ACO1P21399 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ACO1P21399 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACO1P21399 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACO1P21399 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACO1P21399 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACO1P21399 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACO1P21399 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACO1P21399 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACO1P21399 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACO1P21399 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACO1P21399 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACO1P21399 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACO1P21399 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACO1P21399 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACO1P21399 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACO1P21399 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACO1P21399 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACO1P21399 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACO1P21399 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACO1P21399 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ACO1P21399 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACO1P21399 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACO1P21399 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACO1P21399 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACO1P21399 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACO1P21399 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACO1P21399 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACO1P21399 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACO1P21399 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACO1P21399 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACO1P21399 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACO1P21399 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACO1P21399 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACO1P21399 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACO1P21399 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACO1P21399 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACO1P21399 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACO1P21399 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACO1P21399 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACO1P21399 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACO1P21399 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACO1P21399 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACO1P21399 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACO1P21399 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACO1P21399 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACO1P21399 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACO1P21399 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACO1P21399 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACO1P21399 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACO1P21399 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACO1P21399 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACO1P21399 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACO1P21399 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACO1P21399 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACO1P21399 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ACO1P21399 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACO1P21399 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACO1P21399 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACO1P21399 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACO1P21399 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACO1P21399 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACO1P21399 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACO1P21399 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACO1P21399 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACO1P21399 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms