Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASTP20810 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASTP20810 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASTP20810 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASTP20810 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASTP20810 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASTP20810 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASTP20810 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASTP20810 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CASTP20810 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASTP20810 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASTP20810 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASTP20810 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CASTP20810 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASTP20810 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASTP20810 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASTP20810 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASTP20810 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASTP20810 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASTP20810 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASTP20810 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASTP20810 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASTP20810 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASTP20810 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASTP20810 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASTP20810 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASTP20810 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASTP20810 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASTP20810 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CASTP20810 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASTP20810 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASTP20810 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASTP20810 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASTP20810 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASTP20810 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASTP20810 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASTP20810 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASTP20810 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASTP20810 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASTP20810 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASTP20810 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASTP20810 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASTP20810 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CASTP20810 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CASTP20810 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASTP20810 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CASTP20810 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASTP20810 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASTP20810 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASTP20810 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASTP20810 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASTP20810 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASTP20810 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASTP20810 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASTP20810 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASTP20810 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASTP20810 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CASTP20810 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CASTP20810 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASTP20810 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASTP20810 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASTP20810 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASTP20810 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASTP20810 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASTP20810 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASTP20810 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASTP20810 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASTP20810 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASTP20810 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASTP20810 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CASTP20810 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASTP20810 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASTP20810 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASTP20810 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASTP20810 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASTP20810 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASTP20810 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASTP20810 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASTP20810 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASTP20810 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASTP20810 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASTP20810 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CASTP20810 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASTP20810 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASTP20810 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASTP20810 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASTP20810 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CASTP20810 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASTP20810 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASTP20810 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASTP20810 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASTP20810 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CASTP20810 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASTP20810 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASTP20810 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASTP20810 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASTP20810 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASTP20810 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASTP20810 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASTP20810 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms