Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFE3P19532 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFE3P19532 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFE3P19532 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TFE3P19532 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TFE3P19532 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TFE3P19532 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFE3P19532 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFE3P19532 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFE3P19532 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFE3P19532 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFE3P19532 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFE3P19532 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TFE3P19532 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFE3P19532 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TFE3P19532 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFE3P19532 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFE3P19532 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFE3P19532 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFE3P19532 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFE3P19532 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TFE3P19532 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFE3P19532 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFE3P19532 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFE3P19532 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFE3P19532 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFE3P19532 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFE3P19532 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFE3P19532 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFE3P19532 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFE3P19532 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFE3P19532 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFE3P19532 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFE3P19532 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFE3P19532 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFE3P19532 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFE3P19532 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFE3P19532 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFE3P19532 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFE3P19532 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFE3P19532 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TFE3P19532 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFE3P19532 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFE3P19532 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFE3P19532 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFE3P19532 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFE3P19532 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFE3P19532 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFE3P19532 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFE3P19532 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFE3P19532 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFE3P19532 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFE3P19532 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFE3P19532 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFE3P19532 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFE3P19532 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TFE3P19532 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TFE3P19532 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TFE3P19532 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TFE3P19532 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TFE3P19532 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TFE3P19532 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TFE3P19532 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TFE3P19532 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TFE3P19532 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TFE3P19532 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TFE3P19532 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFE3P19532 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFE3P19532 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFE3P19532 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFE3P19532 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFE3P19532 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFE3P19532 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFE3P19532 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFE3P19532 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFE3P19532 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TFE3P19532 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFE3P19532 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFE3P19532 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFE3P19532 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFE3P19532 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFE3P19532 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFE3P19532 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFE3P19532 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFE3P19532 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFE3P19532 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFE3P19532 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFE3P19532 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFE3P19532 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFE3P19532 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFE3P19532 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFE3P19532 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFE3P19532 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFE3P19532 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFE3P19532 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFE3P19532 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFE3P19532 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFE3P19532 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFE3P19532 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFE3P19532 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms