Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCLP19338 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCLP19338 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCLP19338 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCLP19338 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCLP19338 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCLP19338 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCLP19338 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCLP19338 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCLP19338 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCLP19338 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCLP19338 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCLP19338 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCLP19338 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NCLP19338 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCLP19338 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCLP19338 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCLP19338 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCLP19338 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCLP19338 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCLP19338 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCLP19338 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCLP19338 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCLP19338 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCLP19338 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCLP19338 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCLP19338 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCLP19338 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCLP19338 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCLP19338 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCLP19338 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NCLP19338 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCLP19338 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCLP19338 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCLP19338 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCLP19338 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCLP19338 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCLP19338 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCLP19338 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NCLP19338 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCLP19338 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCLP19338 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCLP19338 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCLP19338 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCLP19338 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCLP19338 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCLP19338 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCLP19338 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCLP19338 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCLP19338 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCLP19338 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCLP19338 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCLP19338 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCLP19338 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCLP19338 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCLP19338 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCLP19338 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCLP19338 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCLP19338 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCLP19338 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCLP19338 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCLP19338 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCLP19338 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NCLP19338 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCLP19338 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCLP19338 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCLP19338 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCLP19338 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCLP19338 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCLP19338 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCLP19338 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCLP19338 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCLP19338 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCLP19338 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCLP19338 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCLP19338 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCLP19338 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCLP19338 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCLP19338 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCLP19338 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCLP19338 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NCLP19338 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NCLP19338 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NCLP19338 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NCLP19338 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NCLP19338 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NCLP19338 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NCLP19338 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NCLP19338 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NCLP19338 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCLP19338 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCLP19338 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCLP19338 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCLP19338 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NCLP19338 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCLP19338 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCLP19338 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCLP19338 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCLP19338 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCLP19338 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms