Protein–RNA interactions for Protein: P19320

VCAM1, Vascular cell adhesion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAM1P19320 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VCAM1P19320 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VCAM1P19320 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms