Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNB3P16520 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNB3P16520 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNB3P16520 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNB3P16520 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNB3P16520 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNB3P16520 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GNB3P16520 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GNB3P16520 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNB3P16520 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GNB3P16520 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNB3P16520 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNB3P16520 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNB3P16520 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNB3P16520 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNB3P16520 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNB3P16520 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNB3P16520 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNB3P16520 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNB3P16520 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNB3P16520 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNB3P16520 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNB3P16520 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNB3P16520 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNB3P16520 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GNB3P16520 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNB3P16520 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNB3P16520 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNB3P16520 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNB3P16520 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNB3P16520 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNB3P16520 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNB3P16520 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNB3P16520 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNB3P16520 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNB3P16520 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNB3P16520 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNB3P16520 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNB3P16520 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNB3P16520 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GNB3P16520 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GNB3P16520 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNB3P16520 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GNB3P16520 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNB3P16520 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNB3P16520 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNB3P16520 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNB3P16520 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNB3P16520 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNB3P16520 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNB3P16520 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNB3P16520 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNB3P16520 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNB3P16520 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNB3P16520 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNB3P16520 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNB3P16520 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNB3P16520 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNB3P16520 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNB3P16520 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNB3P16520 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNB3P16520 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNB3P16520 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNB3P16520 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNB3P16520 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNB3P16520 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNB3P16520 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNB3P16520 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNB3P16520 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNB3P16520 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNB3P16520 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB3P16520 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB3P16520 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB3P16520 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB3P16520 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB3P16520 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB3P16520 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB3P16520 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB3P16520 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB3P16520 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB3P16520 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB3P16520 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB3P16520 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB3P16520 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB3P16520 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB3P16520 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB3P16520 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB3P16520 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB3P16520 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB3P16520 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB3P16520 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB3P16520 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB3P16520 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB3P16520 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB3P16520 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB3P16520 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GNB3P16520 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GNB3P16520 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNB3P16520 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNB3P16520 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms