Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAV1P15498 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VAV1P15498 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VAV1P15498 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VAV1P15498 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VAV1P15498 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAV1P15498 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAV1P15498 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAV1P15498 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAV1P15498 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAV1P15498 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VAV1P15498 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VAV1P15498 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAV1P15498 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VAV1P15498 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAV1P15498 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAV1P15498 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAV1P15498 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAV1P15498 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAV1P15498 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAV1P15498 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAV1P15498 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAV1P15498 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAV1P15498 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VAV1P15498 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAV1P15498 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAV1P15498 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAV1P15498 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAV1P15498 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAV1P15498 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAV1P15498 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VAV1P15498 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAV1P15498 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAV1P15498 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAV1P15498 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAV1P15498 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAV1P15498 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAV1P15498 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAV1P15498 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAV1P15498 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAV1P15498 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAV1P15498 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAV1P15498 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAV1P15498 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAV1P15498 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAV1P15498 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAV1P15498 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAV1P15498 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAV1P15498 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAV1P15498 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VAV1P15498 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAV1P15498 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAV1P15498 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAV1P15498 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAV1P15498 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAV1P15498 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAV1P15498 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAV1P15498 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAV1P15498 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAV1P15498 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAV1P15498 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAV1P15498 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VAV1P15498 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAV1P15498 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAV1P15498 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAV1P15498 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAV1P15498 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VAV1P15498 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAV1P15498 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAV1P15498 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VAV1P15498 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAV1P15498 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAV1P15498 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAV1P15498 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAV1P15498 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAV1P15498 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAV1P15498 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAV1P15498 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAV1P15498 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAV1P15498 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAV1P15498 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAV1P15498 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VAV1P15498 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAV1P15498 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAV1P15498 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAV1P15498 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAV1P15498 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAV1P15498 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VAV1P15498 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAV1P15498 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAV1P15498 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAV1P15498 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAV1P15498 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAV1P15498 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VAV1P15498 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAV1P15498 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAV1P15498 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAV1P15498 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAV1P15498 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VAV1P15498 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms