Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
GLI2P10070 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
GLI2P10070 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC33.17■■■□□ 2.9
GLI2P10070 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
GLI2P10070 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.17■■■□□ 2.9
GLI2P10070 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
GLI2P10070 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
GLI2P10070 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
GLI2P10070 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
GLI2P10070 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
GLI2P10070 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
GLI2P10070 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
GLI2P10070 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
GLI2P10070 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
GLI2P10070 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
GLI2P10070 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
GLI2P10070 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
GLI2P10070 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
GLI2P10070 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
GLI2P10070 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
GLI2P10070 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
GLI2P10070 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
GLI2P10070 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
GLI2P10070 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
GLI2P10070 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
GLI2P10070 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
GLI2P10070 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
GLI2P10070 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
GLI2P10070 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
GLI2P10070 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
GLI2P10070 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
GLI2P10070 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
GLI2P10070 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
GLI2P10070 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
GLI2P10070 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
GLI2P10070 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GLI2P10070 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GLI2P10070 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GLI2P10070 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GLI2P10070 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GLI2P10070 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GLI2P10070 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
GLI2P10070 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GLI2P10070 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
GLI2P10070 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
GLI2P10070 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
GLI2P10070 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
GLI2P10070 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
GLI2P10070 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
GLI2P10070 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
GLI2P10070 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GLI2P10070 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
GLI2P10070 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
GLI2P10070 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
GLI2P10070 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
GLI2P10070 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
GLI2P10070 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
GLI2P10070 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC33.11■■■□□ 2.89
GLI2P10070 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
GLI2P10070 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
GLI2P10070 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
GLI2P10070 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
GLI2P10070 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
GLI2P10070 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
GLI2P10070 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
GLI2P10070 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
GLI2P10070 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
GLI2P10070 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
GLI2P10070 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
GLI2P10070 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
GLI2P10070 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
GLI2P10070 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
GLI2P10070 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
GLI2P10070 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
GLI2P10070 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
GLI2P10070 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
GLI2P10070 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
GLI2P10070 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
GLI2P10070 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
GLI2P10070 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
GLI2P10070 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
GLI2P10070 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
GLI2P10070 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
GLI2P10070 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
GLI2P10070 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
GLI2P10070 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
GLI2P10070 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
GLI2P10070 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
GLI2P10070 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
GLI2P10070 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
GLI2P10070 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
GLI2P10070 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
GLI2P10070 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
GLI2P10070 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
GLI2P10070 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
GLI2P10070 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
GLI2P10070 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
GLI2P10070 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
GLI2P10070 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
GLI2P10070 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms