Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
U2AF1L5P0DN76 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
U2AF1L5P0DN76 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
U2AF1L5P0DN76 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
U2AF1L5P0DN76 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
U2AF1L5P0DN76 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
U2AF1L5P0DN76 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
U2AF1L5P0DN76 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
U2AF1L5P0DN76 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
U2AF1L5P0DN76 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
U2AF1L5P0DN76 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
U2AF1L5P0DN76 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
U2AF1L5P0DN76 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
U2AF1L5P0DN76 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
U2AF1L5P0DN76 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
U2AF1L5P0DN76 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
U2AF1L5P0DN76 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
U2AF1L5P0DN76 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
U2AF1L5P0DN76 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
U2AF1L5P0DN76 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
U2AF1L5P0DN76 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
U2AF1L5P0DN76 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
U2AF1L5P0DN76 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
U2AF1L5P0DN76 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
U2AF1L5P0DN76 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
U2AF1L5P0DN76 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
U2AF1L5P0DN76 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
U2AF1L5P0DN76 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
U2AF1L5P0DN76 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms