Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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PKHD1P08F94 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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PKHD1P08F94 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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PKHD1P08F94 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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PKHD1P08F94 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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PKHD1P08F94 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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PKHD1P08F94 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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