Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms