Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
POP4O95707 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
POP4O95707 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POP4O95707 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POP4O95707 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POP4O95707 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POP4O95707 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POP4O95707 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POP4O95707 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POP4O95707 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
POP4O95707 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POP4O95707 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POP4O95707 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POP4O95707 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POP4O95707 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
POP4O95707 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POP4O95707 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POP4O95707 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POP4O95707 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POP4O95707 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POP4O95707 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POP4O95707 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POP4O95707 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
POP4O95707 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POP4O95707 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POP4O95707 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POP4O95707 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POP4O95707 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POP4O95707 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POP4O95707 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POP4O95707 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POP4O95707 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POP4O95707 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POP4O95707 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POP4O95707 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POP4O95707 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POP4O95707 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POP4O95707 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POP4O95707 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POP4O95707 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POP4O95707 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POP4O95707 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POP4O95707 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POP4O95707 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POP4O95707 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POP4O95707 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POP4O95707 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POP4O95707 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
POP4O95707 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POP4O95707 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
POP4O95707 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
POP4O95707 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POP4O95707 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POP4O95707 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POP4O95707 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POP4O95707 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POP4O95707 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POP4O95707 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POP4O95707 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POP4O95707 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POP4O95707 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
POP4O95707 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POP4O95707 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POP4O95707 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POP4O95707 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POP4O95707 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POP4O95707 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POP4O95707 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POP4O95707 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POP4O95707 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POP4O95707 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
POP4O95707 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POP4O95707 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POP4O95707 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POP4O95707 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POP4O95707 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POP4O95707 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POP4O95707 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POP4O95707 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POP4O95707 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POP4O95707 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POP4O95707 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
POP4O95707 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POP4O95707 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POP4O95707 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POP4O95707 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POP4O95707 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POP4O95707 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POP4O95707 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POP4O95707 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
POP4O95707 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POP4O95707 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POP4O95707 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POP4O95707 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POP4O95707 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
POP4O95707 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
POP4O95707 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
POP4O95707 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POP4O95707 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POP4O95707 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms