Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLDN9O95484 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLDN9O95484 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLDN9O95484 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLDN9O95484 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLDN9O95484 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms