Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLDN7O95471 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLDN7O95471 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CLDN7O95471 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLDN7O95471 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLDN7O95471 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CLDN7O95471 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN7O95471 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN7O95471 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN7O95471 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN7O95471 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN7O95471 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN7O95471 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN7O95471 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN7O95471 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN7O95471 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN7O95471 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN7O95471 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN7O95471 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN7O95471 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN7O95471 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN7O95471 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN7O95471 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN7O95471 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN7O95471 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN7O95471 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN7O95471 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN7O95471 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN7O95471 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN7O95471 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN7O95471 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN7O95471 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CLDN7O95471 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN7O95471 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN7O95471 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN7O95471 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN7O95471 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN7O95471 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN7O95471 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN7O95471 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN7O95471 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN7O95471 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN7O95471 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN7O95471 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN7O95471 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN7O95471 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CLDN7O95471 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN7O95471 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN7O95471 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN7O95471 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms