Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ACSL4O60488 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACSL4O60488 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms