Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATP9BO43861 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms