Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLC7A4O43246 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms