Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
O00370 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
O00370 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
O00370 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
O00370 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
O00370 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
O00370 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
O00370 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
O00370 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
O00370 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
O00370 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
O00370 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
O00370 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
O00370 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
O00370 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
O00370 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
O00370 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
O00370 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
O00370 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
O00370 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
O00370 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
O00370 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
O00370 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
O00370 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
O00370 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
O00370 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
O00370 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
O00370 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
O00370 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
O00370 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
O00370 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
O00370 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
O00370 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
O00370 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
O00370 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
O00370 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
O00370 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
O00370 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
O00370 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
O00370 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
O00370 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
O00370 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
O00370 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
O00370 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
O00370 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
O00370 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
O00370 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
O00370 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
O00370 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
O00370 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
O00370 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
O00370 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
O00370 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
O00370 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
O00370 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
O00370 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
O00370 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
O00370 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
O00370 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
O00370 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
O00370 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
O00370 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
O00370 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
O00370 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
O00370 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
O00370 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
O00370 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
O00370 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
O00370 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
O00370 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
O00370 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
O00370 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
O00370 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
O00370 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
O00370 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
O00370 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
O00370 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
O00370 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
O00370 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
O00370 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
O00370 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
O00370 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
O00370 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
O00370 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
O00370 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
O00370 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
O00370 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
O00370 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
O00370 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
O00370 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
O00370 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
O00370 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
O00370 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
O00370 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
O00370 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
O00370 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
O00370 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
O00370 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
O00370 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
O00370 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms