Protein–RNA interactions for Protein: O00212

RHOD, Rho-related GTP-binding protein RhoD, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHODO00212 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHODO00212 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHODO00212 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHODO00212 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RHODO00212 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RHODO00212 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHODO00212 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHODO00212 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHODO00212 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHODO00212 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHODO00212 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHODO00212 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHODO00212 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHODO00212 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHODO00212 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHODO00212 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHODO00212 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHODO00212 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHODO00212 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHODO00212 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHODO00212 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHODO00212 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHODO00212 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHODO00212 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHODO00212 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHODO00212 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHODO00212 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RHODO00212 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHODO00212 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHODO00212 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHODO00212 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHODO00212 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHODO00212 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHODO00212 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHODO00212 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHODO00212 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHODO00212 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHODO00212 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHODO00212 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHODO00212 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHODO00212 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHODO00212 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHODO00212 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHODO00212 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHODO00212 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHODO00212 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RHODO00212 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHODO00212 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHODO00212 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHODO00212 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHODO00212 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHODO00212 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHODO00212 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHODO00212 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHODO00212 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHODO00212 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHODO00212 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHODO00212 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHODO00212 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHODO00212 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHODO00212 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHODO00212 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHODO00212 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHODO00212 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHODO00212 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHODO00212 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHODO00212 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHODO00212 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHODO00212 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHODO00212 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHODO00212 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHODO00212 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHODO00212 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHODO00212 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHODO00212 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHODO00212 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHODO00212 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHODO00212 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHODO00212 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHODO00212 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHODO00212 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHODO00212 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHODO00212 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHODO00212 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHODO00212 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHODO00212 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHODO00212 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHODO00212 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHODO00212 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHODO00212 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHODO00212 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHODO00212 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHODO00212 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHODO00212 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHODO00212 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHODO00212 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHODO00212 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHODO00212 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHODO00212 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHODO00212 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms