Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HACD1B0YJ81 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms