Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms