Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms