Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC85CA6NKD9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms