Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms