Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 SLC3A2-222ENST00000546253 582 ntTSL 416.67■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 28
SF3B1O75533 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 28
SF3B1O75533 HBP1-203ENST00000463202 2646 ntTSL 1 (best)5.05□□□□□ -1.62e-6■■■■■ 28
SF3B1O75533 HBP1-214ENST00000498408 2332 ntTSL 24.75□□□□□ -1.652e-6■■■■■ 28
SF3B1O75533 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.263e-7■■■■■ 28
SF3B1O75533 SLC3A2-212ENST00000538682 1368 ntTSL 1 (best)16.47■□□□□ 0.233e-7■■■■■ 28
SF3B1O75533 SLC3A2-215ENST00000539891 1300 ntTSL 1 (best)11.82□□□□□ -0.523e-7■■■■■ 28
SF3B1O75533 CEP192-204ENST00000507064 706 ntTSL 312.17□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 28
SF3B1O75533 SLC3A2-205ENST00000457660 873 ntTSL 513.02□□□□□ -0.333e-7■■■■■ 27.9
SF3B1O75533 NKTR-214ENST00000478488 698 ntTSL 318.7■□□□□ 0.587e-17■■■■■ 27.9
SF3B1O75533 NKTR-215ENST00000487466 2335 ntTSL 216.65■□□□□ 0.267e-17■■■■■ 27.9
SF3B1O75533 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.284e-6■■■■■ 27.9
SF3B1O75533 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.294e-6■■■■■ 27.9
SF3B1O75533 MVD-203ENST00000562651 908 ntTSL 222.22■■□□□ 1.153e-6■■■■■ 27.8
SF3B1O75533 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 27.8
SF3B1O75533 ALDOA-208ENST00000562679 906 ntTSL 515.66■□□□□ 0.15e-8■■■■■ 27.8
SF3B1O75533 MTPN-202ENST00000435723 879 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.763e-6■■■■■ 27.8
SF3B1O75533 EPB41-210ENST00000482464 675 ntTSL 219.14■□□□□ 0.651e-6■■■■■ 27.7
SF3B1O75533 BUB1-201ENST00000302759 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.783e-6■■■■■ 27.7
SF3B1O75533 BUB1-202ENST00000409311 3287 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.233e-6■■■■■ 27.7
SF3B1O75533 TRIM28-208ENST00000597172 577 ntTSL 210□□□□□ -0.814e-6■■■■■ 27.7
SF3B1O75533 SUGP2-208ENST00000597163 423 ntTSL 33.29□□□□□ -1.884e-6■■■■■ 27.7
SF3B1O75533 HSPA9-207ENST00000507097 1796 ntTSL 214.31□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 27.7
SF3B1O75533 HSPA9-201ENST00000297185 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.71e-6■■■■■ 27.7
SF3B1O75533 SIRT2-214ENST00000476771 584 ntTSL 518.66■□□□□ 0.581e-6■■■■■ 27.7
SF3B1O75533 SIRT2-210ENST00000443898 985 ntTSL 514.78□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 27.7
SF3B1O75533 SIRT2-212ENST00000451193 556 ntTSL 414.78□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 27.7
SF3B1O75533 SIRT2-208ENST00000423526 556 ntTSL 414.52□□□□□ -0.081e-6■■■■■ 27.7
SF3B1O75533 SIRT2-209ENST00000437828 555 ntTSL 414.52□□□□□ -0.081e-6■■■■■ 27.7
SF3B1O75533 SIRT2-205ENST00000407552 890 ntTSL 213.5□□□□□ -0.251e-6■■■■■ 27.7
SF3B1O75533 SIRT2-217ENST00000491960 619 ntTSL 413.5□□□□□ -0.251e-6■■■■■ 27.7
SF3B1O75533 SIRT2-216ENST00000481381 618 ntTSL 312.73□□□□□ -0.371e-6■■■■■ 27.7
SF3B1O75533 SIRT2-211ENST00000447739 578 ntTSL 412.43□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 27.7
SF3B1O75533 RAPGEF2-204ENST00000504604 693 ntTSL 510.07□□□□□ -0.84e-6■■■■■ 27.7
SF3B1O75533 RAPGEF2-206ENST00000505478 838 ntTSL 55.18□□□□□ -1.584e-6■■■■■ 27.7
SF3B1O75533 TBL1XR1-227ENST00000636478 100 ntTSL 50.54□□□□□ -2.321e-6■■■■■ 27.7
SF3B1O75533 RANBP1-203ENST00000411892 584 ntTSL 216.13■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 27.7
SF3B1O75533 ANLN-201ENST00000265748 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.125e-7■■■■■ 27.6
SF3B1O75533 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.335e-7■■■■■ 27.6
SF3B1O75533 AFDN-204ENST00000366809 4839 ntTSL 1 (best)9.93□□□□□ -0.822e-6■■■■■ 27.6
SF3B1O75533 MAT2A-201ENST00000306434 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.836e-7■■■■■ 27.6
SF3B1O75533 RSRC2-212ENST00000527399 1041 ntTSL 515.94■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 27.6
SF3B1O75533 RSRC2-204ENST00000433877 1956 ntTSL 214.04□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 27.6
SF3B1O75533 RSRC2-202ENST00000344591 936 ntTSL 212.89□□□□□ -0.353e-6■■■■■ 27.6
SF3B1O75533 RSRC2-207ENST00000525335 1146 ntTSL 512.86□□□□□ -0.353e-6■■■■■ 27.6
SF3B1O75533 RSRC2-220ENST00000532695 2001 ntTSL 212.3□□□□□ -0.443e-6■■■■■ 27.6
SF3B1O75533 RSRC2-201ENST00000331738 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.083e-6■■■■■ 27.6
SF3B1O75533 RSRC2-211ENST00000527173 2570 ntTSL 25.24□□□□□ -1.573e-6■■■■■ 27.6
SF3B1O75533 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.971e-8■■■■■ 27.6
SF3B1O75533 DUS1L-204ENST00000542088 1040 ntTSL 319.97■□□□□ 0.791e-8■■■■■ 27.6
SF3B1O75533 PLK1-205ENST00000564794 683 ntTSL 518.98■□□□□ 0.631e-8■■■■■ 27.6
SF3B1O75533 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.611e-8■■■■■ 27.6
SF3B1O75533 DUS1L-213ENST00000580731 725 ntTSL 518.29■□□□□ 0.521e-8■■■■■ 27.6
SF3B1O75533 DUS1L-209ENST00000578428 688 ntTSL 217.12■□□□□ 0.331e-8■■■■■ 27.6
SF3B1O75533 DUS1L-205ENST00000577574 473 ntTSL 516.15■□□□□ 0.181e-8■■■■■ 27.6
SF3B1O75533 DUS1L-212ENST00000579854 657 ntTSL 215.5■□□□□ 0.071e-8■■■■■ 27.6
SF3B1O75533 DNM2-218ENST00000591701 863 ntTSL 314.87□□□□□ -0.034e-6■■■■■ 27.6
SF3B1O75533 DUS1L-216ENST00000584871 676 ntTSL 214.19□□□□□ -0.141e-8■■■■■ 27.6
SF3B1O75533 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 27.6
SF3B1O75533 ANKRD36B-201ENST00000258459 5986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 27.6
SF3B1O75533 AARS-203ENST00000565361 839 ntTSL 512.9□□□□□ -0.341e-8■■■■■ 27.6
SF3B1O75533 CAPRIN2-205ENST00000454014 4398 ntTSL 1 (best)12.23□□□□□ -0.451e-8■■■■■ 27.6
SF3B1O75533 PLK1-202ENST00000562272 4135 ntTSL 211.94□□□□□ -0.51e-8■■■■■ 27.6
SF3B1O75533 CAPRIN2-201ENST00000298892 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.541e-8■■■■■ 27.6
SF3B1O75533 GNL2-201ENST00000373062 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -12e-6■■■■■ 27.6
SF3B1O75533 DNM2-209ENST00000587485 530 ntTSL 48.53□□□□□ -1.044e-6■■■■■ 27.6
SF3B1O75533 CAPRIN2-204ENST00000433722 3012 ntTSL 1 (best)7.63□□□□□ -1.191e-8■■■■■ 27.6
SF3B1O75533 CAPRIN2-208ENST00000537553 6543 ntTSL 27.17□□□□□ -1.261e-8■■■■■ 27.6
SF3B1O75533 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.38e-7■■■■■ 27.6
SF3B1O75533 CAPRIN2-216ENST00000548676 3221 ntTSL 1 (best)6.81□□□□□ -1.321e-8■■■■■ 27.6
SF3B1O75533 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.391e-8■■■■■ 27.6
SF3B1O75533 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.411e-8■■■■■ 27.6
SF3B1O75533 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.522e-6■■■■■ 27.6
SF3B1O75533 NUP205-206ENST00000477620 1800 ntTSL 54.91□□□□□ -1.621e-8■■■■■ 27.6
SF3B1O75533 CAST-242ENST00000515063 654 ntTSL 1 (best)3.75□□□□□ -1.814e-6■■■■■ 27.6
SF3B1O75533 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC3.53□□□□□ -1.842e-6■■■■■ 27.6
SF3B1O75533 CAPRIN2-219ENST00000620681 926 ntTSL 22.26□□□□□ -2.051e-8■■■■■ 27.6
SF3B1O75533 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.342e-6■■■■■ 27.6
SF3B1O75533 GPI-208ENST00000588991 2021 ntTSL 221.27■□□□□ 0.992e-6■■■■■ 27.6
SF3B1O75533 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 27.6
SF3B1O75533 GPI-202ENST00000415930 4000 ntTSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.12e-6■■■■■ 27.6
SF3B1O75533 KMT5A-207ENST00000478781 725 ntTSL 531.27■■■□□ 2.63e-6■■■■■ 27.5
SF3B1O75533 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.276e-7■■■■■ 27.5
SF3B1O75533 TRIM24-205ENST00000493595 811 ntTSL 35.19□□□□□ -1.582e-6■■■■■ 27.5
SF3B1O75533 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.142e-7■■■■■ 27.5
SF3B1O75533 MYL4-208ENST00000572316 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.282e-7■■■■■ 27.5
SF3B1O75533 MYL4-207ENST00000572303 544 ntTSL 311.83□□□□□ -0.522e-7■■■■■ 27.5
SF3B1O75533 MYL4-201ENST00000354968 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.582e-7■■■■■ 27.5
SF3B1O75533 MYL4-206ENST00000571981 920 ntTSL 311.4□□□□□ -0.582e-7■■■■■ 27.5
SF3B1O75533 MYL4-210ENST00000576874 641 ntTSL 310.72□□□□□ -0.692e-7■■■■■ 27.5
SF3B1O75533 MYL4-205ENST00000570772 582 ntTSL 310.71□□□□□ -0.692e-7■■■■■ 27.5
SF3B1O75533 MYL4-203ENST00000536623 650 ntTSL 510.28□□□□□ -0.762e-7■■■■■ 27.5
SF3B1O75533 MYL4-209ENST00000573747 640 ntTSL 59.24□□□□□ -0.932e-7■■■■■ 27.5
SF3B1O75533 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.562e-6■■■■■ 27.5
SF3B1O75533 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.562e-6■■■■■ 27.5
SF3B1O75533 DDX17-203ENST00000403230 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)16.83■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 27.5
SF3B1O75533 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 27.5
SF3B1O75533 DDX17-201ENST00000216019 6441 ntTSL 1 (best)13.08□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 27.5
SF3B1O75533 SRRM2-228ENST00000576878 1141 ntTSL 218.93■□□□□ 0.621e-8■■■■■ 27.5
SF3B1O75533 DYRK1A-207ENST00000462274 1189 ntTSL 1 (best)28.03■■■□□ 2.081e-6■■■■■ 27.4
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 4192.2 ms