Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G9

DYNC1LI1, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI1Q9Y6G9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms