Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RAD54BQ9Y620 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms