Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX8Q9Y5X2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms