Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms