Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC36.05■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
RAD54L2Q9Y4B4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC36■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC36■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC36■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC35.99■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
RAD54L2Q9Y4B4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms