Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CHTOPQ9Y3Y2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms