Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF13BQ9Y275 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms