Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRID1Q9ULK0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms