Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU6

TRHDE, Thyrotropin-releasing hormone-degrading ectoenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHDEQ9UKU6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRHDEQ9UKU6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRHDEQ9UKU6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRHDEQ9UKU6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRHDEQ9UKU6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRHDEQ9UKU6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRHDEQ9UKU6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRHDEQ9UKU6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRHDEQ9UKU6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRHDEQ9UKU6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRHDEQ9UKU6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRHDEQ9UKU6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRHDEQ9UKU6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRHDEQ9UKU6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRHDEQ9UKU6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRHDEQ9UKU6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRHDEQ9UKU6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRHDEQ9UKU6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRHDEQ9UKU6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRHDEQ9UKU6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRHDEQ9UKU6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRHDEQ9UKU6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRHDEQ9UKU6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRHDEQ9UKU6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRHDEQ9UKU6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRHDEQ9UKU6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRHDEQ9UKU6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRHDEQ9UKU6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRHDEQ9UKU6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms