Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CROTQ9UKG9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms