Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GGA1Q9UJY5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GGA1Q9UJY5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms