Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPUSD1Q9UJJ7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPUSD1Q9UJJ7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms