Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6

OPN4, Melanopsin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4Q9UHM6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms